Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLEQ07864 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLEQ07864 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLEQ07864 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms