Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SCN1BQ07699 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SCN1BQ07699 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms