Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAD51Q06609 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms