Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP7AQ04656 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP7AQ04656 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms