Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR1Q03591 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms