Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYP4A11Q02928 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms