Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP2BQ02880 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms