Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IRF8Q02556 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms