Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC10Q01780 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms