Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXC5Q00444 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms