Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNAQ00169 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms