Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL8P80075 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL8P80075 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms