Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms