Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERVS71-1P61550 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms