Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SPCS3P61009 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPCS3P61009 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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