Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TPTEP56180 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TPTEP56180 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TPTEP56180 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPTEP56180 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPTEP56180 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms