Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAD23BP54727 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms