Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNB3P54284 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms