Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFNA3P52797 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms