Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RORCP51449 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RORCP51449 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RORCP51449 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RORCP51449 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RORCP51449 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms