Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF6P49848 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF6P49848 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF6P49848 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF6P49848 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms