Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPFP49454 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPFP49454 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPFP49454 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CENPFP49454 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPFP49454 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPFP49454 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms