Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNI2P48788 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms