Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NESP48681 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NESP48681 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
NESP48681 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NESP48681 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NESP48681 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NESP48681 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NESP48681 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NESP48681 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NESP48681 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms