Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NMUP48645 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NMUP48645 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NMUP48645 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NMUP48645 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NMUP48645 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NMUP48645 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NMUP48645 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms