Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XCR1P46094 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms