Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TGFBR1P36897 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms