Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKARP32238 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKARP32238 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKARP32238 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKARP32238 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKARP32238 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKARP32238 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKARP32238 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.6 ms