Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA10P31260 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA10P31260 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms