Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD10P28358 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD10P28358 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD10P28358 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD10P28358 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms