Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB5P28074 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms