Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB4P28070 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms