Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA3P26006 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms