Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

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Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNCP24821 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNCP24821 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNCP24821 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNCP24821 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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