Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRDP23468 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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