Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HRCP23327 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HRCP23327 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HRCP23327 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HRCP23327 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HRCP23327 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HRCP23327 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HRCP23327 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HRCP23327 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HRCP23327 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms