Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CXCL3P19876 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CXCL3P19876 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CXCL3P19876 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CXCL3P19876 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CXCL3P19876 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CXCL3P19876 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CXCL3P19876 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CXCL3P19876 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL3P19876 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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