Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCLP19338 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCLP19338 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCLP19338 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCLP19338 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCLP19338 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCLP19338 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCLP19338 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCLP19338 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCLP19338 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCLP19338 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCLP19338 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCLP19338 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms