Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB3P14651 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms