Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RLBP1P12271 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RLBP1P12271 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms