Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TPRP12270 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TPRP12270 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TPRP12270 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPRP12270 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms