Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms