Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RD3LP0DJH9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms