Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms