Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PKHD1P08F94 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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