Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB1P08034 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB1P08034 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB1P08034 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB1P08034 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB1P08034 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB1P08034 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB1P08034 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB1P08034 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB1P08034 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms