Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPN2P04844 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPN2P04844 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPN2P04844 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPN2P04844 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms