Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCELO95171 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCELO95171 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCELO95171 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms