Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBBP9O75884 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP9O75884 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms