Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
VAMP4O75379 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAMP4O75379 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms